Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FRMPD1Q5SYB0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FRMPD1Q5SYB0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMPD1Q5SYB0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms