Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PCID2Q5JVF3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCID2Q5JVF3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms