Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD3Q5JV73 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD3Q5JV73 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms