Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERC4Q5GLZ8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms