Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf116Q5BN46 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf116Q5BN46 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms