Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms