Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFT2D3Q587I9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFT2D3Q587I9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms