Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms