Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms