Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZBED5Q49AG3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms