Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLFNL1Q499Z3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFNL1Q499Z3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms