Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms