Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFAP100Q494V2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP100Q494V2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms