Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP20-2Q3LI61 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms