Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SPHKAPQ2M3C7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
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