Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms