Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC27Q2M243 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC27Q2M243 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC27Q2M243 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms