Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICBQ29980 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICBQ29980 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICBQ29980 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICBQ29980 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICBQ29980 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICBQ29980 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICBQ29980 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICBQ29980 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICBQ29980 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICBQ29980 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICBQ29980 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICBQ29980 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MICBQ29980 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MICBQ29980 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MICBQ29980 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICBQ29980 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICBQ29980 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICBQ29980 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICBQ29980 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICBQ29980 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICBQ29980 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MICBQ29980 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms