Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q1T7F1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q1T7F1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q1T7F1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q1T7F1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q1T7F1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms