Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTC4SQ16873 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LTC4SQ16873 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTC4SQ16873 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTC4SQ16873 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTC4SQ16873 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTC4SQ16873 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTC4SQ16873 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTC4SQ16873 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTC4SQ16873 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTC4SQ16873 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms