Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HADHQ16836 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HADHQ16836 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HADHQ16836 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHQ16836 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHQ16836 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHQ16836 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHQ16836 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHQ16836 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHQ16836 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHQ16836 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHQ16836 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHQ16836 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HADHQ16836 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HADHQ16836 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HADHQ16836 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HADHQ16836 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HADHQ16836 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HADHQ16836 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HADHQ16836 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HADHQ16836 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms