Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NRF1Q16656 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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NRF1Q16656 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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NRF1Q16656 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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NRF1Q16656 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRF1Q16656 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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NRF1Q16656 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRF1Q16656 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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