Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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