Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NEDD8Q15843 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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