Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGN3Q15651 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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