Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRADDQ15628 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRADDQ15628 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRADDQ15628 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRADDQ15628 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRADDQ15628 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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