Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUM3Q15397 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUM3Q15397 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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