Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCOLCEQ15113 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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