Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERC3Q15034 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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