Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms