Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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