Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2CQ14957 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2CQ14957 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms