Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFTN1Q14699 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFTN1Q14699 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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