Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MDC1Q14676 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MDC1Q14676 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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