Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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