Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEDD9Q14511 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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