Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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