Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARF1Q14162 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
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