Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDK13Q14004 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
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