Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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DDX39BQ13838 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDX39BQ13838 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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DDX39BQ13838 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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