Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PEX6Q13608 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PEX6Q13608 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PEX6Q13608 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PEX6Q13608 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PEX6Q13608 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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