Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF5Q13568 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms