Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXE3Q13461 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXE3Q13461 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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