Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATMQ13315 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATMQ13315 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATMQ13315 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATMQ13315 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATMQ13315 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATMQ13315 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATMQ13315 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATMQ13315 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATMQ13315 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATMQ13315 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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