Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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