Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNH2Q12809 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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