Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 ATG3YNR007C 933 nt2.41□□□□□ -2.02
HMS1Q12398 SIN3YOL004W 4611 nt2.41□□□□□ -2.02
HMS1Q12398 EAP1YKL204W 1899 nt2.41□□□□□ -2.02
HMS1Q12398 SHS1YDL225W 1656 nt2.41□□□□□ -2.02
HMS1Q12398 TAF2YCR042C 4224 nt2.41□□□□□ -2.02
HMS1Q12398 ORC1YML065W 2745 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YDR115WYDR115W 318 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 TMA20YER007C-A 546 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YIL054WYIL054W 318 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 RPS22AYJL190C 393 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YJR087WYJR087W 351 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 DAD2YKR083C 402 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YLR271WYLR271W 825 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 PAI3YMR174C 207 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 SLP1YOR154W 1764 nt2.4□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 ORC2YBR060C 1863 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 KEI1YDR367W 666 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YIP5YGL161C 933 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YAP5YIR018W 738 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 PRP21YJL203W 843 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 ERG29YMR134W 714 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 NGL1YOL042W 1092 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 DBP10YDL031W 2988 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 SUL1YBR294W 2580 nt2.39□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 AXL1YPR122W 3627 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 IRA2YOL081W 9240 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 MST27YGL051W 705 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YIL174WYIL174W 228 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 ECM9YKR004C 1134 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YMR254CYMR254C 309 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 GIM3YNL153C 390 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 DSE4YNR067C 3354 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YOR331CYOR331C 558 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 RPS12YOR369C 432 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YBR062CYBR062C 543 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YPL150WYPL150W 2706 nt2.38□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 RGR1YLR071C 3249 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 AYT1YLL063C 1425 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 SEN54YPL083C 1404 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 snR5snR5 204 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 TIM11YDR322C-A 291 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 ERG28YER044C 447 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 FAR7YFR008W 666 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 ACF4YJR083C 930 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 SFT1YKL006C-A 294 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 COX8YLR395C 237 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YMR181CYMR181C 465 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 RPL16BYNL069C 597 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YOL029CYOL029C 606 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 SGT1YOR057W 1188 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YHR078WYHR078W 1659 nt2.37□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 ARK1YNL020C 1917 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 MAK5YBR142W 2322 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 CTF13YMR094W 1437 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 snR59snR59 78 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 VPS63YLR261C 327 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 PRE8YML092C 753 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 PCK1YKR097W 1650 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YCL020WYCL020W 1317 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 JJJ2YJL162C 1752 nt2.36□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YPK1YKL126W 2043 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 SKP2YNL311C 2292 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 SRB4YER022W 2064 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 SSP1YHR184W 1716 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 NCB2YDR397C 441 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 TCD1YHR003C 1290 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YJL086CYJL086C 369 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 SRP21YKL122C 504 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YLR257WYLR257W 966 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 RPS16AYMR143W 432 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 snR191snR191 274 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 BOI1YBL085W 2943 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YLR446WYLR446W 1302 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 VPS64YDR200C 1815 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 MLH1YMR167W 2310 nt2.35□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 SWR1YDR334W 4545 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 OCA6YDR067C 675 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 TDA2YER071C 381 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 GPI14YJR013W 1212 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YLR224WYLR224W 1110 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YMR187CYMR187C 1296 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YOL057WYOL057W 2136 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YOR169CYOR169C 465 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 HEM4YOR278W 828 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 YPL276WYPL276W 438 nt2.34□□□□□ -2.03
HMS1Q12398 BIT61YJL058C 1632 nt2.34□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 TFB1YDR311W 1929 nt2.34□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 MFB1YDR219C 1398 nt2.34□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 TOR1YJR066W 7413 nt2.34□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 YPL216WYPL216W 3309 nt2.34□□□□□ -2.04
HMS1Q12398 NEL1YHR035W 1893 nt2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.1 ms