Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 SPO11YHL022C 1197 nt2.53□□□□□ -2
SLM3Q12093 GRX5YPL059W 453 nt2.53□□□□□ -2
SLM3Q12093 YBR287WYBR287W 1284 nt2.53□□□□□ -2
SLM3Q12093 NET1YJL076W 3570 nt2.53□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 CDC37YDR168W 1521 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 UTP15YMR093W 1542 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 IRC8YJL051W 2469 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 STN1YDR082W 1485 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YKL100CYKL100C 1764 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 URB2YJR041C 3525 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 DYN2YDR424C 279 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YGL024WYGL024W 336 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 MRPL38YKL170W 417 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 ADI1YMR009W 540 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 SIR4YDR227W 4077 nt2.52□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 JJJ2YJL162C 1752 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 MLH1YMR167W 2310 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 MIX14YDR031W 366 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 VAB2YEL005C 849 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YGR115CYGR115C 780 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YKL091CYKL091C 933 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 ISU1YPL135W 498 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 RRP15YPR143W 753 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 snR24snR24 89 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YBR300CYBR300C 498 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 SRB4YER022W 2064 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 RTT107YHR154W 3213 nt2.51□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 COG3YER157W 2406 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 ANR2YKL047W 1551 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 RAV2YDR202C 1056 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YFR054CYFR054C 579 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YGL039WYGL039W 1047 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 THG1YGR024C 714 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YLR302CYLR302C 363 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 ARC18YLR370C 537 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 GIM5YML094W 492 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 BIT61YJL058C 1632 nt2.5□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 HSH155YMR288W 2916 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 VPS38YLR360W 1320 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 ARK1YNL020C 1917 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 SSN2YDR443C 4263 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 KAP104YBR017C 2757 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 snR83snR83 306 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 DAD2YKR083C 402 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 VMA6YLR447C 1038 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 URA5YML106W 681 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 DGR1YNL130C-A 147 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 ATP11YNL315C 957 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 PDS5YMR076C 3834 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 NOP12YOL041C 1380 nt2.49□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 MED1YPR070W 1701 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 SLK19YOR195W 2466 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 SMC2YFR031C 3513 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 SRD1YCR018C 666 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 SEC31YDL195W 3822 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 KEI1YDR367W 666 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 LOC1YFR001W 615 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 LIN1YHR156C 1023 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YLL044WYLL044W 447 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 CDC123YLR215C 1083 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 AIM36YMR157C 768 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 PAI3YMR174C 207 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 RPL16BYNL069C 597 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 GRE2YOL151W 1029 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 MED8YBR193C 672 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 SPF1YEL031W 3648 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 DIS3YOL021C 3006 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 NDT80YHR124W 1884 nt2.48□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 SWR1YDR334W 4545 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YNL193WYNL193W 1677 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 KRE2YDR483W 1329 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 PSY2YNL201C 2577 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 VMA8YEL051W 771 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YHL044WYHL044W 708 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 MCR1YKL150W 909 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YNL043CYNL043C 321 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 RXT2YBR095C 1293 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 MBA1YBR185C 837 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 AVT2YEL064C 1443 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 VHR2YER064C 1518 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 BRE5YNR051C 1548 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YJL016WYJL016W 1686 nt2.47□□□□□ -2.01
SLM3Q12093 YKR078WYKR078W 1758 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 NSE4YDL105W 1209 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 UBC13YDR092W 462 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 RSR1YGR152C 819 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 YMR181CYMR181C 465 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 DBF20YPR111W 1695 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 TFB1YDR311W 1929 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 KIN82YCR091W 2163 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 ASI3YNL008C 2031 nt2.46□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 RAD18YCR066W 1464 nt2.45□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 HER1YOR227W 3741 nt2.45□□□□□ -2.02
SLM3Q12093 FRE2YKL220C 2136 nt2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.8 ms