Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNA1Q09470 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms