Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIRE1Q08AE8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIRE1Q08AE8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms